由于原声吉他指板一般没有漆层，因此其清洁方法与清洁琴体稍有不同。几家公司专门为此研究出清洁剂（如，Dunlop的指板清洁剂与Dean Markley的护理剂），同时也可使用一点优质钢丝棉来移除指板污垢，钢丝棉对付特别脏的指板非常有效，同样也可以用来清洁品丝。然而使用时，请确保钢丝棉和木纹方向相平行，将刮伤减少到最低。当指板清洁后，品丝看起来依旧脏，可以尝试使用Planet Waves品丝清洁套装，包括五片抛光纸及保护模板，保护指板区域免遭划伤。

想要彻底清洁指板及保养吉他，可以将少许柠檬或者矿物油（或者任何保养木材的其他类型的指板清洁剂）滴到软质布料上，擦到木材里。大多数生产吉他护理产品的厂家专门为此制作了一种柠檬油。不要滴过多，过多的油需要花很长一段时间才能干，如果在晾干之前，刚刚清洁的指板沾染到灰尘污垢，那就白白付出了努力。不需要经常进行指板清理，一年做一次护理就足够了。